Im Hauptverzeichnis des Wikis finden Sie folgende Struktur vor (einige unwichtige Unterordner sind nicht aufgeführt):

bin
conf
data
 ⎿ attic
 ⎿ cache
 ⎿ index
 ⎿ locks
 ⎿ media
 ⎿ media_attic
 ⎿ media_meta
 ⎿ meta
 ⎿ pages
 ⎿ tmp
inc
 ⎿ Action
 ⎿ Form
 ⎿ lang
 ⎿ Menu
 ⎿ parser
 ⎿ Ui
lib
 ⎿ exe
 ⎿ images
 ⎿ plugins
 ⎿ scripts
 ⎿ styles
 ⎿ tpl
vendor

In diesem Ordner befinden sich PHP-Skripte, die nicht vom Browser aus aufgerufen, sondern von einer Kommandozeile aus gestartet werden. Mit dem Skript indexer.php kann zum Beispiel die Suchdatenbank neu aufgebaut werden, so wie es auch das Plugin searchindex tut.

Eine Übersicht aller verfügbaren Skripte sowie deren Bedienung ist auf der DokuWiki-Seite cli abrufbar (in englischer Sprache).

In diesem Ordner liegen alle Konfigurationsdateien des Wikis. Die wichtigsten Dateien in diesem Ordner sind:

acl.auth.php
In dieser Datei werden alle Zugriffsregeln gespeichert.

local.php
In dieser Datei werden Ihre Einstellungen aus der Konfiguration gespeichert.

users.auth.php
In dieser Datei sind die Daten aller Benutzer (Benutzername, verschlüsseltes Passwort, voller Name, Email-Adresse und Gruppenmitgliedschaft) gespeichert.

Evtl. werden im Verzeichnis conf Unterordner angelegt, wenn Sie die Sprachdateien anpassen oder eigene CSS-Regeln anlegen.

Im Ordner data befinden sich einige Unterordner. Diese beinhalten im Einzelnen:

attic
Alte Versionen von Wiki-Seiten

cache
Zwischengespeicherte Versionen von Wiki-Seiten, damit diese schneller geladen werden können. Der Inhalt dieses Ordners kann ohne Folgen gelöscht werden, die Dateien werden dann einfach neu erzeugt.

index
In diesem Ordner liegen die Dateien des Suchindexes (der Datenbank für die Suchfunktion).

locks
Hier liegen Informationen über Seiten, die momentan für die Bearbeitung gesperrt sind, weil sie derzeit bereits von einem Nutzer bearbeitet werden. In diesem Ordner sollten sich in der Regel nur wenige oder keine Dateien befinden.

media
In diesem Ordner werden Dateien abgelegt, die im Medienmanager hochgeladen werden.
Sie können auch direkt Dateien in diesen Ordner hineinkopieren wenn Sie große Datenmengen haben und nicht den Umweg über den Medienmanager gehen möchten, müssen dafür aber wie unter Datenimport auf Dateisystemebene beschrieben einige Regeln beachten.

media_attic
In diesem Ordner werden alte Versionen von Dateien abgelegt, sofern diese Funktion nicht in der Konfiguration deaktiviert wurde. Um die Datenmenge klein zu halten, ist dies die Standardeinstellung im Einsatzleiterwiki.

media_meta
Hier werden Meta-Informationen zu Medien-Dateien gespeichert, u.a. wer die Datei wann hochgeladen hat, welche Größe diese hat, etc.

media_meta
In diesem Verzeichnis wird gespeichert, welche Seite von wem wann bearbeitet wurde, was die Änderung war, etc.

pages
In diesem Ordner werden die Wiki-Seiten gespeichert. Wiki-Seiten sind technisch gesehen ganz normale Textdateien, die mit externen Programmen erzeugt werden und dann in dieses Verzeichnis kopiert werden können. Beachten Sie dazu die Hinweise auf der Seite Datenimport auf Dateisystemebene

tmp
In diesem Ordner werden nur vorübergehend zwischengespeicherte Inhalte abgelegt.

In diesem Ordner liegen die Systemdateien des Wikis. Diese müssen Sie im Normalfall nicht bearbeiten.

Im Ordner lib sind für Sie möglicherweise die beiden Unterordner plugins und tpl interessant:

plugins
In diesem Ordner sind alle Plugins abgelegt. Weitere Infos über Plugins finden Sie in der Hilfe.

tpl
Im Ordner tpl sind Templates¹⁾ hinterlegt. Standardmäßig wird das Template dokuwiki verwendet. Eine Datenbank weiterer Templates finden Sie auf der Seite Sammlung von DokuWiki-Templates (englisch).

In diesem Ordner ist Software von Dritten hinterlegt, auf die das Wiki zurückgreift. Eine Bearbeitung dieser Dateien sollte nicht notwendig sein.